自闭症发病较早，在治疗上需要综合的治疗策略。首先，药物治疗，目前为止，还没有治疗自闭症的特 效药。药物治疗的作用还是非常有限的，但是许多自闭症的孩子伴有情绪障碍、冲动行为、刻板重复的动作，这些可以用精神科的药物进行干预，可以得到有效的缓解，这样也有利于接下来的康复训练。
第二个，非常重要的治疗策略就是康复训练。各种康复治疗的理论和技术，可以应用在这些孩子的训练过程当中。常用的有应用行为分析方法、结构化的教学，或者感统训练或者地板时光等等，取决于机构或老师的受训背景。通过训练，帮助孩子发音，帮助孩子去理解语言、识别物品，帮助孩子去进行人际交往等。
第三个，心理治疗。自闭症的孩子除了表面上的语言障碍、社交障碍、刻板行为，他们的心理往往存在着明显的异常，过于封闭、自卑，包括各种认知上的偏颇。心理治疗可能需要多种形式，包括沙盘游戏、音乐治疗、舞蹈治疗、行为矫正治疗，帮助这些孩子形成良好的行为习惯，纠正一些日常刻板的冲动性的行为，帮助孩子发展自信心，提升他们的心理素质。许多高功能自闭症孩子，尤其需要心理帮助。
第四个，辅助性的仪器治疗，包括经颅磁刺激等一些物理治疗，去有效的刺激大脑的语言区。然后，非常重要的是自闭症孩子的家长，一定要积极地参与进来，要学习自闭症的知识，要学习自闭症孩子的培养技巧，要去懂孩子的心理，切不可一味的依赖训练机构。一定要让孩子在早期得到充分的训练，无论是在训练机构、家里、商场、马路上，家长掌握了这些自闭症孩子的特殊教育方式，无疑让我们的孩子能够得到较大化的训练，这样才能会收到一个较好的效果。

儿童的行为与神经递质密切相关，研究调查中显示：中枢神经系统5-羟色胺或多巴胺活性下降是导致自闭症的关键性因素，神经递质的异常会使患儿表现出孤独以及和周围人建立不起来和谐的关系，患儿会存在语言和认知上的障碍，极力避免与人的视线接触，婴儿脑伤包括在怀孕期间窘迫性流产等因素而造成大脑发育不全，生产过程中早产、难产、新生儿脑伤，以及婴儿期因其感染脑炎、脑膜炎等疾病造成的脑部伤害等因素，都可能增加自闭症机会。很多自闭症患儿可能是没有语言或迟滞，特殊的语言用法，例如重复问话者的部分或全部问话内容;背诵出曾听过的广告词、话、歌曲等;你、我、他分不清楚，即使随着年龄增长语言沟通有些进步，其对话也呈现出机械式地将所背的回答出来，自闭症相对于其它能力有较佳的记忆性，但理解、抽象、推理能力有缺陷。